Periode Babilonia dan Persia (586-333 SM)
Pada tahun 586 SM, bangsa Babilonia, di bawah raja Nebukadnezar II merebut Yerusalem, menghancurkan Kuil Salomo, mengakhiri kerajaan Daud, dan membawa rakyat ke dalam pembuangan. Hanya yang termiskin yang tertinggal di Yehuda, yang sekarang menjadi provinsi Yehud di Babel dengan ibukotanya di Mizpa di bekas wilayah Benyamin, di utara Yerusalem. Beberapa tahun kemudian, lagi-lagi menurut Alkitab, gubernur Yehud dibunuh oleh saingannya, memicu eksodus pengungsi lainnya, kali ini ke Mesir. Jadi sekitar tahun 580, orang-orang Yehuda dapat ditemukan di tiga lokasi terpisah, kaum elit di Babel (di mana, secara kebetulan, mereka tampaknya telah diperlakukan dengan baik), sebuah komunitas besar di Mesir, dan sisa-sisa di Yehuda. Pengasingan berakhir ketika Koresh Agung dari Persia menaklukkan Babel (secara tradisional 538 SM). Bangsa Persia membentuk kembali Yehuda/Yehud sebagai sebuah provinsi ("Yehud medinata") di dalam satrapy "Beyond the River", dan selama satu abad berikutnya beberapa orang buangan kembali ke Yerusalem. Di sana mereka akhirnya membangun kembali Bait Suci (secara tradisional 516/515 SM), tetapi selama lebih dari satu abad ibu kota administratif tetap berada di Mizpa. Sementara itu, Samaria berlanjut sebagai provinsi Semarina dalam satrapy yang sama dengan Yehud.
Periode Persia
Pada tahun 539 SM, Persia menaklukkan Babilonia dan pada tahun 537 SM, meresmikan periode Persia dalam sejarah Yahudi. Pada tahun 520 SM Koresh Agung mengizinkan orang Yahudi untuk kembali ke Yudea dan membangun kembali Bait Suci (selesai 515 SM). Dia menunjuk Zerubabel (cucu dari raja Yudea kedua sampai terakhir, Yoyakhin) sebagai gubernur, tetapi tidak mengizinkan pemulihan kerajaan. Pengaruh Zoroastrianisme pada monoteisme, Yudaisme, serta agama Kristen masih menjadi bahan perdebatan akademis.
Tanpa raja yang berkuasa, Bait Suci menjadi lebih kuat, dan para imam menjadi otoritas yang dominan. Namun, Bait Suci Kedua telah dibangun di bawah kekuasaan asing, dan masih ada pertanyaan yang tersisa tentang legitimasinya. Hal ini memberikan kondisi bagi berbagai sekte untuk berkembang di dalam Yudaisme selama berabad-abad mendatang, yang masing-masing mengklaim mewakili "Yudaisme". Sebagian besar dari sekte-sekte ini biasanya mencegah hubungan sosial, terutama pernikahan, dengan anggota sekte lain.
Akhir dari Pembuangan Babilonia tidak hanya menyaksikan pembangunan Bait Suci Kedua, tetapi, menurut Hipotesis Dokumenter, versi terakhir dari Taurat juga. Meskipun para imam mengendalikan monarki dan Bait Suci, para ahli Taurat dan orang bijak (yang kemudian menjadi rabi) memonopoli studi Taurat, yang (mulai dari zaman Ezra) dibacakan di depan umum pada hari-hari pasar. Para orang bijak ini mengembangkan dan mempertahankan tradisi lisan di samping Kitab Suci, dan diidentifikasikan dengan para nabi. Menurut Geza Vermes, ahli-ahli Taurat seperti itu sering disapa dengan menggunakan istilah dasar penghormatan, "tuan".
Periode Helenistik dan Romawi (333 SM-70 M)
Periode Helenistik dimulai pada tahun 332 SM ketika Alexander Agung menaklukkan Persia. Setelah kematiannya pada tahun 323 SM, kekaisarannya dibagi-bagi di antara para jenderalnya. Pada awalnya, Yudea diperintah oleh Ptolemies Mesir-Hellenik, tetapi pada tahun 198 SM, Kekaisaran Seleukus Suriah-Hellenik, di bawah Antiokhus III, mengambil alih kendali atas Yudea.
Periode Helenistik menyaksikan kanonisasi Tanakh (Alkitab Ibrani), menurut salah satu teori, dan munculnya tradisi suci ekstra-Alkitabiah. Bukti paling awal dari tradisi mistisisme Yahudi mengelilingi kitab Yehezkiel, yang ditulis selama Pembuangan Babilonia. Namun, hampir semua teks mistik yang diketahui, ditulis pada akhir periode Bait Suci Kedua. Beberapa sarjana berpikir bahwa tradisi esoterik Kabbalah (mistisisme Yahudi), dipengaruhi oleh kepercayaan Persia, filsafat Platonis dan Gnostisisme.
2 Esdras 14:45-46, yang ditulis pada abad kedua Masehi, menyatakan: "Umumkanlah dua puluh empat kitab yang pertama kali engkau tulis, dan biarlah orang yang layak dan yang tidak layak membacanya, tetapi simpanlah ketujuh puluh kitab yang ditulis terakhir, untuk diberikan kepada orang-orang bijak di antara bangsamu." Ini adalah referensi pertama yang diketahui tentang Alkitab Ibrani yang dikanonisasi, dan ketujuh puluh teks non-kanonik mungkin bersifat mistik; Talmud menunjukkan tradisi mistik lainnya yang mungkin berakar pada Yudaisme Bait Kedua.
Timur Dekat adalah kosmopolitan, khususnya selama periode Helenistik. Beberapa bahasa digunakan, dan masalah lingua franca masih menjadi bahan perdebatan. Orang-orang Yahudi hampir pasti berbicara bahasa Aram di antara mereka sendiri. Bahasa Yunani sering digunakan di seluruh bagian timur Mediterania. Yudaisme berubah dengan cepat, bereaksi dan beradaptasi dengan dunia politik, budaya, dan intelektual yang lebih besar, dan pada gilirannya menarik minat non-Yahudi. Sejarawan Shaye Cohen mengamati:
Semua Yudaisme pada periode Helenistik, baik diaspora maupun di tanah Israel, telah di-Helenisasi, yaitu, merupakan bagian integral dari budaya dunia kuno. Beberapa jenis Yudaisme lebih ter-Helenisasi daripada yang lain, tetapi tidak ada satu pun yang merupakan pulau tersendiri. Adalah suatu kesalahan untuk membayangkan bahwa tanah Palestina melestarikan bentuk Yudaisme yang "murni" dan bahwa diaspora adalah rumah dari bentuk Yudaisme yang tercemar atau diencerkan. Maka, istilah "Yudaisme Helenistik" masuk akal, hanya sebagai indikator kronologis untuk periode dari Aleksander Agung sampai Makabe atau mungkin sampai penaklukan Romawi pada abad pertama SM. Akan tetapi, sebagai istilah deskriptif untuk jenis Yudaisme tertentu, istilah ini tidak ada artinya, karena semua Yudaisme pada periode Helenistik adalah "Helenistik". (Cohen 1987: 37)
Perjuangan Budaya dengan Hellenisme
Banyak orang Yahudi tinggal di Diaspora, dan provinsi Yudea, Samaria, dan Galilea dihuni oleh banyak orang bukan Yahudi (yang sering menunjukkan ketertarikan pada Yudaisme). Orang Yahudi harus hidup dengan nilai-nilai Helenisme dan filsafat Helenistik, yang sering kali secara langsung bertentangan dengan nilai-nilai dan tradisi mereka sendiri. Secara umum, budaya Helenistik melihat dirinya sebagai peradaban, membawa nilai-nilai dan cara-cara yang beradab kepada orang-orang yang mereka anggap picik atau terbelakang atau merosot.
Sebagai contoh, rumah-rumah pemandian bergaya Yunani dibangun di depan Bait Suci di Yerusalem, misalnya, dan bahkan di kota itu gimnasium menjadi pusat kehidupan sosial, atletik, dan intelektual. Banyak orang Yahudi, termasuk beberapa imam yang lebih aristokrat, memeluk lembaga-lembaga ini, meskipun orang Yahudi yang melakukannya sering dipandang rendah karena sunat mereka, yang dilihat orang Yahudi sebagai tanda perjanjian mereka dengan Tuhan, tetapi budaya Helenistik dipandang sebagai pencemaran estetika tubuh. Akibatnya, beberapa orang Yahudi mulai meninggalkan praktik sunat (dan dengan demikian perjanjian mereka dengan Allah), sementara yang lain meremehkan dominasi Yunani.
Pada saat yang sama ketika orang Yahudi menghadapi perbedaan budaya di depan pintu mereka, mereka harus menghadapi paradoks dalam tradisi mereka sendiri: hukum Taurat mereka hanya berlaku untuk mereka, dan untuk para proselit, tetapi Tuhan mereka, mereka percaya, adalah satu-satunya Tuhan dari semua. Situasi ini menyebabkan munculnya penafsiran-penafsiran baru terhadap Taurat, yang beberapa di antaranya dipengaruhi oleh pemikiran Helenis dan sebagai tanggapan terhadap minat bangsa-bangsa bukan Yahudi terhadap Yudaisme. Pada periode inilah banyak konsep dari filsafat Yunani awal masuk atau mempengaruhi Yudaisme, serta perdebatan dan sekte-sekte dalam agama dan budaya pada masa itu.
Pada tahun 331 SM Alexander Agung mengambil alih Kekaisaran Persia. Setelah kematiannya pada tahun 323 SM, kekaisarannya runtuh, dan provinsi Yehud menjadi bagian dari kerajaan Mesir, yang diperintah oleh dinasti Ptolemeus. Pemerintahan Ptolemaik bersifat ringan: Aleksandria menjadi kota Yahudi terbesar di dunia, dan Ptolemeus II Philadelphus dari Mesir (281-246 SM) mempromosikan budaya Yahudi, mensponsori penerjemahan Septuaginta dari Taurat. Periode ini juga menjadi awal mula munculnya kaum Farisi dan partai-partai Bait Kedua Yahudi lainnya seperti kaum Saduki dan Essenes. Tetapi pada awal abad ke-2 SM Yehud jatuh ke tangan penguasa Suriah Seleukus, Antiokhus IV Epifanes (174-163 SM), yang, berbeda dengan toleransi yang ditunjukkan oleh Ptolemid, berusaha untuk melakukan Hellenisasi total terhadap orang Yahudi. Penodaannya terhadap Bait Suci memicu pemberontakan nasional, yang berakhir dengan pengusiran orang-orang Siria dan penahbisan kembali Bait Suci di bawah Makabe.
Kerajaan yang didirikan oleh Makabe adalah upaya sadar untuk menghidupkan kembali Yehuda yang digambarkan dalam Alkitab: sebuah monarki Yahudi yang diperintah dari Yerusalem dan membentang di atas semua wilayah yang pernah diperintah oleh Daud dan Salomo. Untuk melaksanakan proyek ini, raja-raja Hasmonean menaklukkan (dan secara paksa memeluk agama Yahudi) orang-orang Moab, Edom, dan Amon yang dulu pernah ada, serta kerajaan Israel yang hilang.
Umumnya, orang Yahudi menerima pemerintahan asing ketika mereka hanya diharuskan membayar upeti, dan jika tidak, mereka diizinkan untuk memerintah diri mereka sendiri secara internal. Namun demikian, orang Yahudi terbagi antara mereka yang mendukung hellenisasi dan mereka yang menentangnya, dan terbagi atas kesetiaan kepada Ptolemies atau Seleucid. Ketika Imam Besar Simon II meninggal pada tahun 175 SM, konflik pecah antara pendukung putranya Onias III (yang menentang hellenisasi, dan mendukung Ptolemies) dan putranya Jason (yang mendukung hellenisasi, dan mendukung Seleucid). Periode intrik politik pun terjadi, dengan para pendeta seperti Menelaus yang menyuap raja untuk memenangkan jabatan Imam Besar, dan tuduhan pembunuhan terhadap pesaing yang bersaing untuk mendapatkan gelar tersebut. Hasilnya adalah perang saudara yang singkat.
Sejumlah besar orang Yahudi berbondong-bondong ke sisi Yason, dan pada tahun 167 SM raja Seleukus IV, Antiokhus IV, menyerbu Yudea, memasuki Bait Suci, dan melucuti uang dan benda-benda upacara. Yason melarikan diri ke Mesir, dan Antiokhus memberlakukan program hellenisasi paksa, yang mengharuskan orang Yahudi untuk meninggalkan hukum dan adat istiadat mereka sendiri di bawah ancaman pembantaian. Pada titik ini Mattathias dan kelima putranya, Yohanes, Eleazar, Simon, Yonatan, dan Yehuda Makabe, imam-imam dari keluarga Hasmon yang tinggal di desa pedesaan Modein (diucapkan "Mo-Ah-Dein"), mengambil alih kepemimpinan pemberontakan berdarah dan akhirnya berhasil melawan Seleukus.
Yehuda membebaskan Yerusalem pada tahun 165 SM dan memulihkan Bait Suci. Pertempuran terus berlanjut, dan Yehuda serta saudaranya Yonatan terbunuh. Pada tahun 141 SM, sebuah majelis imam dan yang lainnya mengukuhkan Simon sebagai imam besar dan pemimpin, yang pada dasarnya mendirikan dinasti Hasmonean. Ketika Simon terbunuh pada tahun 135 SM, putranya (dan keponakan Yehuda) Yohanes Hyrcanus menggantikannya sebagai imam besar dan raja.
Kerajaan Hasmonean
Setelah mengalahkan pasukan Seleukus, Yohanes Hyrcanus mendirikan monarki baru dalam bentuk dinasti imam Hasmonean pada tahun 152 SM - dengan demikian menjadikan para imam sebagai otoritas politik dan juga otoritas keagamaan. Meskipun kaum Hasmonean secara populer dipandang sebagai pahlawan dan pemimpin karena melawan Seleukus, beberapa orang menganggap pemerintahan mereka tidak memiliki legitimasi religius yang diberikan oleh keturunan dinasti Daud dari Era Bait Suci Pertama.
Orang Saduki, Eseni, dan Farisi
Keretakan antara para imam dan orang bijak tumbuh selama periode Helenistik, ketika orang-orang Yahudi menghadapi pergumulan politik dan budaya yang baru. Sekitar waktu ini, partai Saduki muncul sebagai partai para imam dan para elit sekutu (nama Saduki berasal dari Zadok, imam besar Bait Suci pertama).
Kaum Eseni adalah gerakan mistis-religius awal lainnya, yang diyakini telah menolak imam-imam besar yang ditunjuk Seleukus, atau imam-imam besar Hasmonean, sebagai sesuatu yang salah. Tetapi mereka segera menolak Bait Suci Kedua, dengan alasan bahwa komunitas Essene itu sendiri adalah Bait Suci yang baru, dan bahwa ketaatan kepada hukum Taurat merupakan bentuk pengorbanan yang baru.
Meskipun kurangnya perhatian mereka terhadap Bait Suci Kedua mengasingkan kaum Essenes dari massa besar orang Yahudi, gagasan mereka bahwa yang suci bisa ada di luar Bait Suci juga dimiliki oleh kelompok lain, kaum Farisi ("separatis"), yang berbasis di dalam komunitas ahli-ahli Taurat dan orang bijak. Namun, arti dari nama itu tidak jelas.
Selama periode Hasmonean, kaum Saduki dan Farisi berfungsi terutama sebagai partai politik (kaum Essenes tidak berorientasi politik). Perbedaan politik antara kaum Saduki dan Farisi menjadi jelas ketika kaum Farisi menuntut raja Hasmonean, Aleksander Jannai, untuk memilih antara menjadi raja dan menjadi Imam Besar dengan cara tradisional. Tuntutan ini menyebabkan perang saudara singkat yang berakhir dengan penindasan berdarah terhadap kaum Farisi, meskipun di ranjang kematiannya, sang raja menyerukan rekonsiliasi antara kedua pihak. Aleksander digantikan oleh jandanya, yang saudaranya adalah seorang Farisi terkemuka. Setelah kematiannya, putranya yang tertua, Hyrcanus II, mencari dukungan dari kaum Farisi, dan putranya yang lebih muda, Aristobulus, mencari dukungan dari kaum Saduki.
Pada tahun 64 SM, jenderal Romawi Pompey mengambil alih Yerusalem dan menjadikan kerajaan Yahudi sebagai klien Roma. Pada tahun 57-55 SM Aulus Gabinius, prokonsul Syria, membaginya menjadi Galilea, Samaria & Yudea, dengan 5 distrik Sanhedrin/Synedrion (dewan hukum). Pada tahun 40-39 SM Herodes Agung diangkat menjadi Raja Yahudi oleh Senat Romawi, tetapi pada tahun 6 M penggantinya, Herodes Arkhelaus, etnarkh Yudea, digulingkan oleh kaisar Augustus dan wilayahnya dianeksasi sebagai Provinsi Iudaea di bawah administrasi Romawi langsung: ini menandai berakhirnya Yehuda sebagai kerajaan yang secara teoritis bahkan secara independen.