Zooxanthellae
Beberapa dinoflagellata adalah zooxanthellae: endosimbion eukariota laut, dan hewan seperti karang anthozoa. Karang pembentuk terumbu karang ini sangat bergantung pada mereka. Organisme lain yang dapat menjadi inang zooxanthellae termasuk ubur-ubur, kerang, foraminifera, siput laut yaitu nudibranch, dan juga ciliata dan radiolaria.
Pasang merah
Dinoflagellata bertanggung jawab atas 'pasang merah' yang dapat meracuni ikan. Mereka kadang-kadang berkembang dalam konsentrasi lebih dari satu juta sel per mililiter. Beberapa spesies menghasilkan neurotoksin, yang dalam jumlah seperti itu membunuh ikan dan terakumulasi dalam filter feeder seperti kerang-kerangan, yang pada gilirannya dapat menularkannya kepada orang yang memakannya. Fenomena ini disebut pasang merah, dari warna mekar yang diberikan pada air. Tidak semua mekarnya dinoflagellata berbahaya. Kerlip kebiruan yang terlihat di air laut pada malam hari sering kali berasal dari mekarnya dinoflagellata bioluminescent, yang memancarkan kilatan cahaya pendek ketika terganggu.
Klasifikasi
Meskipun diklasifikasikan sebagai eukariota, nukleus dinoflagellata tidak memiliki beberapa fitur utama dari nukleus eukariotik. Bahkan, Dodge menyebut inti dinoflagellata sebagai mesokariotik, karena memiliki karakteristik perantara antara area DNA melingkar dari bakteri prokariotik dan inti eukariotik yang terdefinisi dengan baik. Kelompok ini, bagaimanapun, memang mengandung organel eukariotik yang khas, seperti kompleks golgi, mitokondria, dan kloroplas.
Kelompok ini mengandung banyak organel dan gaya hidup yang kompleks. Beberapa memiliki struktur seperti mata vertebrata; beberapa memiliki nematocysts; beberapa hidup sebagai plasmodia (bentuk multinukleat); beberapa memiliki dua flagella; dinoflagellata fotosintetik mengandung "susunan yang membingungkan" dari jenis plastid; dan seluruh genetika dan biologi sel mereka eksentrik.
Fosil
Fosil dinoflagellata penting dalam stratigrafi, penanggalan dan korelasi strata. Selama hidupnya, dinoflagellata memiliki bentuk planktonik yang bergerak dan fase kista yang tahan yang memungkinkan mereka bertahan hidup selama musim dingin dalam sedimen. Hanya kista yang menjadi fosil. Kemunculan pertama mereka yang pasti adalah pada periode Silurian, dengan radiasi besar di era Mesozoikum.p440 Mereka diklasifikasikan sebagai Filum Dinomastigota oleh Margulis dan rekannya.