Metilasi DNA adalah cara utama aktivitas gen disesuaikan selama hidup, terutama selama perkembangan awal.
Ini adalah proses di mana gugus metil ditambahkan ke DNA. Ini menekan transkripsi gen. Dua dari empat nukleotida DNA, sitosin dan adenin, dapat dimetilasi. Karena metilasi adenin terbatas pada prokariota, semua transkripsi eukariota diatur dengan menekan sitosin.
Menekan gen adalah dasar dari epigenetika, studi tentang perubahan aktivitas gen yang tidak disebabkan oleh perubahan urutan DNA. Ini adalah studi tentang ekspresi gen, cara gen menghasilkan efek fenotipik mereka.
Perubahan dalam aktivitas gen oleh metilasi dapat berlangsung selama sisa hidup sel, dan untuk banyak generasi sel melalui pembelahan sel. Namun, tidak ada perubahan dalam urutan DNA yang mendasari organisme. Sebaliknya, faktor non-keturunan menyebabkan gen organisme berperilaku (mengekspresikan diri) secara berbeda.

