Di dalam masjid, orang-orang harus tetap fokus untuk beribadah kepada Allah. Untuk alasan ini, ada sejumlah aturan tentang perilaku yang benar di masjid. Beberapa aturan ini sama di seluruh dunia, seperti tidak ada sepatu yang boleh dipakai di ruang salat. Aturan lainnya berbeda dari satu masjid ke masjid lainnya.
Pemimpin doa
Pada umumnya dipandang baik untuk memiliki seseorang yang memimpin shalat, meskipun hal ini tidak sepenuhnya diperlukan. Orang yang biasanya memimpin shalat disebut imam. Ia haruslah orang yang bebas dan jujur. Dia juga harus menjadi otoritas dalam menjawab pertanyaan-pertanyaan tentang agama. Di masjid-masjid yang dibangun atau yang dikelola oleh pemerintah, imam dipilih oleh penguasa. Di masjid-masjid swasta, masyarakat memilih imam, melalui pemungutan suara terbanyak.
Hanya pria yang boleh memimpin doa untuk pria. Wanita diperbolehkan memimpin doa untuk jemaat yang hanya ada wanita.
Menghadiri masjid
Selain mencuci, ada aturan lain yang juga berlaku bagi mereka yang masuk ke masjid, bahkan jika mereka tidak ingin salat di sana. Dilarang memakai sepatu di area berkarpet di ruang salat. Beberapa masjid juga tidak mengizinkan memakai sepatu di bagian lain, meskipun ini mungkin tidak dikhususkan untuk salat.
Islam mengharuskan umatnya mengenakan pakaian yang menunjukkan kesopanan. Akibatnya, baik pria maupun wanita harus mengikuti aturan ini ketika mereka menghadiri masjid (meskipun masjid mungkin tidak selalu menegakkan aturan). Pria seharusnya datang ke masjid dengan mengenakan pakaian yang longgar dan bersih yang tidak menunjukkan bentuk tubuh. Demikian pula, wanita yang datang ke masjid diharapkan mengenakan pakaian longgar, kemeja, celana yang menutupi pergelangan tangan dan pergelangan kaki dan menutupi kepala mereka seperti dengan jilbab. Banyak Muslim, terlepas dari latar belakang etnis mereka, mengenakan pakaian Timur Tengah yang terkait dengan Islam Arab untuk acara-acara khusus dan doa di masjid.
Masjid adalah tempat ibadah. Untuk alasan ini, mereka yang berada di dalam masjid harus menghormati mereka yang sedang salat. Pembicaraan keras atau diskusi tentang topik yang bisa jadi tidak sopan, dilarang di daerah di mana orang sedang berdoa. Juga dianggap tidak sopan untuk berjalan di depan umat Muslim yang sedang salat atau mengganggu mereka.
Pria dan wanita berdoa di bagian yang berbeda
Hukum Islam mengharuskan pria dan wanita untuk dipisahkan di aula salat. Idealnya, wanita harus salat di belakang pria. Khalifah kedua Umar pada suatu waktu melarang wanita untuk menghadiri masjid, terutama di malam hari, karena ia takut mereka akan digoda oleh pria, sehingga ia menyuruh mereka untuk salat di rumah. Kadang-kadang bagian khusus dari masjid diberi pagar untuk wanita; misalnya, gubernur Mekah pada tahun 870 memiliki tali yang diikatkan di antara tiang-tiang untuk membuat tempat terpisah bagi wanita.
Banyak masjid saat ini akan menempatkan wanita di belakang penghalang atau partisi atau di ruangan lain. Masjid-masjid di Asia Selatan dan Asia Tenggara menempatkan pria dan wanita di ruangan terpisah, karena pemisahan itu sudah ada sejak berabad-abad yang lalu. Di hampir dua pertiga masjid di Amerika, wanita salat di belakang partisi atau di area terpisah, bukan di ruang salat utama; beberapa masjid tidak menerima wanita sama sekali. Meskipun ada bagian hanya untuk wanita dan anak-anak, Masjidil Haram di Mekah tidak dipisahkan.
Non-Muslim di masjid
Beberapa sarjana hukum Islam percaya bahwa non-Muslim dapat diizinkan masuk ke dalam masjid, selama mereka tidak tidur atau makan di sana. Pengikut mazhab Maliki dalam yurisprudensi Islam tidak setuju. Mereka mengatakan bahwa non-Muslim tidak boleh diizinkan masuk ke dalam masjid sama sekali.
Negara-negara yang berbeda memiliki pendapat yang berbeda tentang pertanyaan tersebut. Hampir semua masjid di Jazirah Arab dan juga Maroko tidak mengizinkan non-Muslim. Masjid Hassan II di Casablanca adalah salah satu dari hanya dua masjid di Maroko yang saat ini terbuka untuk non-Muslim.
Di Arab Saudi modern, Masjidil Haram dan seluruh Mekah hanya terbuka bagi umat Muslim. Demikian juga, Masjid al-Nabawi dan kota Madinah yang mengelilinginya juga terlarang bagi mereka yang tidak mempraktikkan Islam. Untuk masjid-masjid di daerah lain, yang paling umum diambil adalah bahwa non-Muslim hanya dapat memasuki masjid jika diberikan izin untuk melakukannya oleh umat Islam dan jika mereka memiliki alasan yang tepat.
Di Turki modern, turis non-Muslim diperbolehkan memasuki masjid mana pun, tetapi harus mematuhi aturan kesopanan. Mengunjungi masjid hanya diperbolehkan di antara waktu salat; pengunjung harus mengenakan celana panjang dan melepas sepatu mereka; wanita harus menutupi kepala mereka; tidak boleh berfoto; tidak boleh berbicara keras. Tidak ada referensi ke agama lain yang diizinkan (tidak ada salib di kalung, tidak ada gerakan salib, dll.).
Namun, ada juga banyak tempat lain di barat maupun di dunia Islam di mana non-Muslim dipersilakan untuk memasuki masjid. Sebagian besar masjid di Amerika Serikat, misalnya, melaporkan menerima pengunjung non-Muslim setiap bulannya. Banyak Masjid di seluruh Amerika Serikat menyambut non-Muslim sebagai tanda keterbukaan kepada seluruh komunitas dan untuk mendorong konversi ke Islam.
Anjing
Anjing biasanya dilarang memasuki masjid, tetapi pada tanggal 24 September 2008, Dewan Hukum Muslim Inggris membuat keputusan khusus, yang disebut fatwa, yang memberikan izin kepada seorang Muslim tunanetra untuk membawa anjing pemandunya ke dalam masjid.