Cope pulang ke Philadelphia sebelum Perang Saudara berakhir. Dia menikahi seorang gadis Quaker yang dikenalnya, Annie Pim. Dia tinggal di sebuah peternakan dan pernikahan diadakan di rumahnya.
Cope menulis makalah tentang ikan, paus, dan satu tentang fosil katak dengan ekor.p835 Ayah Cope memberikan uang kepada sebuah perguruan tinggi Quaker kecil bernama Haverford College. Perguruan tinggi itu memberi Cope gelar master kehormatan dan mempekerjakannya untuk mengajar Zoologi. p48
Cope melakukan perjalanan ilmiah ke barat Amerika dan menulis surat kepada orang tuanya dan kepada istri dan putrinya saat melakukan perjalanan tersebut. Dia mengatakan kepada ayahnya bahwa mengajar terlalu banyak menyita waktunya untuk membuat penemuan ilmiah.p143/6 Dia berhenti dari pekerjaannya di perguruan tinggi. Dia bersama istri dan putrinya kemudian pindah ke Haddonfield agar lebih dekat dengan tempat tidur fosil di New Jersey barat.
Di Haddonfield, New Jersey terdapat marlpits, di mana kerangka dinosaurus ditemukan pada tahun 1858 oleh William Foulke dan diberi nama Hadrosaurus foulkii oleh Dr. Leidy dari Akademi Ilmu Pengetahuan Alam Philadelphia.p151/8 Cope menemukan lebih banyak fosil di marlpit di sana. Misalnya, ia mendeskripsikan Elasmosaurus platyurus dan Laelaps pada tahun 1868. Edward Cope juga melakukan ekspedisi ke gua-gua; gua terakhir yang dikunjunginya adalah Gua Wyandotte di Indiana pada tahun 1871. p151/5
Pada usia 30-an, Quaker menulis banyak makalah ilmiah yang diterbitkan. Charles Sternberg mengatakan bahwa di ladang fosil Kansas Cope mengalami "serangan mimpi buruk yang parah . . . . setiap hewan yang kami temukan jejaknya di siang hari bermain dengannya di malam hari . . . . kadang-kadang dia akan kehilangan setengah malam dalam tidur yang melelahkan ini". p167
Cope juga mencari fosil di bagian barat Amerika Serikat. Pada tahun 1872 ia mengeksplorasi batuan Eosen. Batuan itu berusia 55 hingga 38 juta tahun. Pada tahun itu, ia bekerja terlalu banyak dan mengalami gangguan.p583 Pada tahun 1873 ia mempelajari lapisan Titanothere (strata) di timur laut Colorado. Titanothere adalah herbivora besar yang telah punah. p183/194
Survei Wheeler
Pada tahun 1874 Cope menjadi sukarelawan untuk Survei Wheeler. Perjalanan pemetaan geologi ini dipimpin oleh George Montague Wheeler. Mereka memetakan bagian Amerika Serikat di sebelah barat meridian ke-100.p200 Garis meridian ke-100 di sebelah barat adalah batas antara wilayah Barat yang kering dan wilayah Timur yang hujan di Amerika Serikat.
Pada tahun 1874 Cope menemukan formasi Puerco di New Mexico selama Survei Wheeler.p200 Formasi Puerco adalah lapisan batuan lunak setebal 500 kaki di sepanjang hulu Sungai Puerco dekat Kuba, New Mexico. Itu adalah napal hijau dan hitam (yang mengandung bahan kimia yang digunakan dalam pembuatan pupuk). Fosil-fosil kemudian ditemukan oleh seseorang di formasi serupa di sebelah barat sana di daerah yang berbeda. Cope mengatakan bahwa fosil-fosil itu berasal dari formasi Puerco yang ditemukannya. Tebingnya mungkin telah digali oleh sungai dalam waktu yang lama dan sepertinya sudah ada di sana sejak lama. Itu adalah sesuatu yang belum pernah dilihat oleh para ilmuwan yang dia kenal sebelumnya. Sebagai bagian dari Survei Wheeler, dia bisa berbelanja di komisaris. Dia bisa memasukkan temuannya ke dalam laporan survei yang diterbitkan. Dia membawa serta istri dan putrinya dalam satu perjalanan survei, menyewa sebuah rumah untuk mereka. Sebagai seorang sukarelawan, ia membayar sendiri. p63
Kemerdekaan
Ketika Cope berusia 35 tahun, ayahnya meninggal, meninggalkan seperempat juta dolar.p837 Tahun berikutnya, 1876, Cope memindahkan istri dan putrinya dari rumah mereka di dekat kebun apel di Haddonfield, New Jersey kembali ke Philadelphia, Pennsylvania - kali ini ke sebuah rumah deret di Kota. Dia membeli dua unit dan menggunakan yang di sebelahnya sebagai laboratorium paleo untuk koleksi fosilnya. Dia berhenti melakukan pekerjaan lapangan untuk mengejar ketertinggalannya dalam menulis. Dia menyewa tim untuk mencari fosil untuknya. Dan, dia membantu Pameran Centennial Philadelphia menyiapkan pameran fosil mereka.p218 Pada tahun 1877 ia mampu membeli setengah dari American Naturalist.
Dia menerbitkan makalah dengan sangat cepat sehingga saingannya, Profesor Marsh, meragukan kapan fosil Cope ditemukan. Pada bulan Agustus 1878 ketika ia berusia 38 tahun, Cope berlayar ke Kepulauan Inggris untuk menghadiri konvensi ilmiah di Dublin Irlandia. Dia kemudian berlayar ke Prancis untuk menghadiri konvensi ilmiah selama dua hari di sana. Di salah satu konvensi ia memutuskan untuk membeli beberapa kotak fosil Argentina, mungkin untuk museum di Philadelphia.
Ketika Cope kembali, koleksi selama dua tahun yang dikumpulkan oleh anak buahnya, Lucas, telah menunggunya. Ini termasuk Camarasaurus, sauropoda. p42