Inkuisisi adalah agen hukum Gereja Katolik untuk melawan bid'ah pada Abad Pertengahan. Inkuisisi melakukan dua hal utama. Pertama, Inkuisisi mengeluarkan daftar (Indeks) buku-buku yang diterbitkan yang dilarang karena mengandung bid'ah. Umat beriman dilarang membaca buku-buku seperti itu. Kedua, menuntut orang-orang yang dianggap bersalah karena bid'ah.

Inkuisisi versi selanjutnya memiliki kekuatan untuk menggunakan penyiksaan atau ancaman penyiksaan untuk mendapatkan pengakuan dan konversi agama. Inkuisisi memiliki kekuasaan untuk memerintahkan eksekusi. Metode standarnya adalah membakar para bidat hidup-hidup, atau menggantung mereka di depan umum. Perbuatan yang sebenarnya dilakukan oleh otoritas sipil.

Nama lengkap Inkuisisi adalah Kongregasi Suci untuk Penyebaran Iman (bahasa Latin: Sacra Congregatio de Propaganda Fide) dari Gereja Katolik. Inkuisisi berkembang secara bertahap. Inkuisisi permanen pertama didirikan pada tahun 1229. Inkuisisi ini dijalankan oleh para Dominikan di Roma. Pada tahun 1478 Ferdinand II dari Aragon dan Ratu Isabella I dari Kastilia mendirikan Inkuisisi Spanyol.

Pada tahun 1542 Paus Paulus III mendirikan Kongregasi Kantor Suci Inkuisisi sebagai pengadilan yang dikelola oleh para kardinal dan pejabat lainnya. Versi ini mengawasi Inkuisisi lokal di negara-negara lain, dan juga menyelidiki kasus-kasus penting dari Italia. Kasus yang paling terkenal yang diadili adalah kasus Galileo Galilei pada tahun 1633.

Kata Inkuisisi berasal dari bahasa Latin quaerere. Itu berarti berbalik, mengajukan pertanyaan.