Flora vagina atau mikrobiota adalah mikroorganisme kecil yang merupakan bagian dari organ reproduksi yang sehat pada wanita. Manusia memiliki banyak organisme yang sangat kecil yang merupakan bagian normal dari tubuh manusia. Mikroorganisme ini hanya dapat dilihat dengan mikroskop. Organisme ini adalah bakteri dan jamur. Hampir semuanya tidak menyebabkan penyakit, tetapi masih normal untuk memilikinya di dalam atau di luar tubuh.
Mikroorganisme kecil ini disebut mikrobiota oleh para peneliti. Ada mikrobiota di perut, kulit, mulut, mata, dan mikrobiota di vagina. Mikrobiota pada manusia membantu menghentikan infeksi yang disebabkan oleh bakteri lain. Mikrobiota vagina membantu menjaga kesehatan vagina. Mereka membantu mencegah infeksi yang disebabkan bakteri lain. Bakteri yang menyebabkan penyakit atau infeksi disebut patogen. Mikrobiota vagina yang normal menghentikan pertumbuhan patogen.
Ketika seorang wanita memeriksakan diri ke dokter karena ada cairan yang keluar dari vaginanya, dokter mungkin akan menguji wanita tersebut untuk mengetahui adanya bakteri patogen. Patogen dapat tumbuh terlalu cepat. Mereka dapat tumbuh lebih cepat daripada mikrobiota vagina yang normal dan sehat. Infeksi dapat membuat cairan keluar dari vagina. Ini disebut keputihan. Bakteri baik dan sehat yang menjaga vagina bebas dari penyakit disebut Lactobacillus. Ada bakteri baik lainnya yang menjaga vagina tetap sehat. Beberapa nama mereka adalah: Peptostreptococcus, Propionibacterium, dan Actinomyces.
Jika seorang wanita terkena penyakit menular seksual, maka akan mengubah mikrobiota vagina. Mikrobiota vagina yang sehat tidak dapat menghentikan atau menyembuhkan infeksi menular seksual.
