Musim badai Atlantik 2006 adalah peristiwa tahunan dalam siklus tahunan siklon tropis. Secara resmi dimulai pada tanggal 1 Juni 2006, dan berlangsung hingga 30 November 2006. Sepuluh badai tropis terbentuk selama musim tersebut. Lima menjadi badai, dan satu badai tropis tidak memiliki nama. Ini Mempengaruhi Negara Bagian Florida Amerika Serikat

Musim ini tidak biasa karena tidak ada badai yang mendarat di Amerika Serikat. Satu badai tropis, Badai Tropis Zeta dari musim 2005, berlanjut hingga bulan Januari, yang merupakan kedua kalinya dalam catatan bahwa siklon tropis ada dalam dua tahun kalender.

Karena musim 2005 yang super aktif, prakiraan cuaca dan ahli meteorologi mengira bahwa musim 2006 juga akan sangat aktif, tetapi tidak seaktif 2005. Namun demikian, peristiwa El Niño, dikombinasikan dengan kehadiran Lapisan Udara Sahara di atas Samudra Atlantik tropis, memberikan kontribusi pada musim yang lambat dan memaksa semua siklon tropis untuk menghilang setelah tanggal 2 Oktober.