Polifili adalah istilah dalam kladistik. Istilah ini menggambarkan sekelompok organisme yang nenek moyang bersama terakhirnya bukan anggota kelompok tersebut. Cara lain untuk mengekspresikan hal ini adalah dengan mengatakan bahwa polifili mencakup kelompok-kelompok yang beberapa anggotanya merupakan keturunan dari populasi leluhur.
Diagram menunjukkan bahwa burung dan mamalia memang terkait, tetapi hanya pada tingkat amniote awal. Dalam hal evolusi, ada jurang yang sangat lebar di antara mereka.
Yang lebih umum dalam taksonomi tradisional adalah memasukkan semua keturunan (katakanlah, mamalia yang hidup) tanpa kelompok tempat mereka berevolusi (yang akan menjadi beberapa clade dalam therapsida). Hal ini dilakukan untuk kenyamanan; tetapi itu membuat mamalia menjadi polifiletik.
Klasifikasi biologis bertujuan untuk mengelompokkan spesies bersama-sama sehingga setiap kelompok adalah keturunan dari satu nenek moyang yang sama. Sebuah kelompok polifiletik dapat "diperbaiki" baik dengan mengecualikan clades atau dengan menambahkan nenek moyang bersama.
Menurut kladistik, seharusnya tujuan klasifikasi adalah untuk memastikan bahwa semua kelompok bersifat monofiletik. Namun, ahli taksonomi lain berpendapat bahwa ada tempat yang valid untuk kelompok-kelompok yang paraphyletic, atau mengandung nenek moyang bersama mereka yang paling baru tetapi tidak semua keturunan dari nenek moyang itu.
