Carsonella ruddii

Pengarang: Leandro Alegsa

18-06-2022

Candidatus Carsonella ruddii adalah gamma proteobacterium endosimbiotik. Ia memiliki genom terkecil yang diketahui dari bakteri mana pun.

Spesies ini merupakan endosimbion yang terdapat pada semua spesies serangga pemakan getah floem yang dikenal sebagai psyllid. Endosimbion terjadi dalam struktur khusus yang dikenal sebagai bakteriom.

Pada tahun 2006 genom dari satu strain Ca. C. ruddi diurutkan di RIKEN di Jepang dan Universitas Arizona. Genom tersebut merupakan kromosom sirkuler 159.662 pasang basa dan memiliki kepadatan pengkodean yang tinggi (97%) dengan banyak gen yang tumpang tindih dan panjang gen yang berkurang. Jumlah gen yang diprediksi adalah 182, juga yang terendah dalam catatan (NCBI-Genome). Banyak gen yang dianggap penting untuk kehidupan tampaknya hilang, menunjukkan bahwa spesies tersebut mungkin telah mencapai status seperti organel.

Sebagai perbandingan, Mycoplasma genitalium, yang memiliki genom terkecil dari semua organisme yang hidup bebas, memiliki genom 521 gen.

Pertanyaan dan Jawaban

T: Apa itu Candidatus Carsonella ruddii?

J: Candidatus Carsonella ruddii adalah gamma proteobacterium endosimbiotik yang terdapat pada semua spesies serangga pemakan getah floem yang dikenal sebagai psyllid.

T: Berapa ukuran genom Candidatus Carsonella ruddii?

J: Genom Candidatus Carsonella ruddii adalah genom terkecil yang diketahui dari semua bakteri dan merupakan kromosom melingkar dengan 159.662 pasangan basa.

T: Berapa banyak gen yang diperkirakan ada di Candidatus Carsonella ruddii?

J: Jumlah gen yang diprediksi dalam Candidatus Carsonella ruddii adalah 182, yang merupakan jumlah terendah dalam catatan (NCBI-Genome).

T: Berapa kepadatan pengkodean genom Candidatus Carsonella ruddii?

J: Genom Candidatus Carsonella ruddii memiliki kepadatan pengkodean yang tinggi, yaitu 97%.

T: Apa yang dimaksud dengan bakteriom?

J: Bakteriom adalah struktur khusus di mana endosimbion terdapat di Candidatus Carsonella ruddii.

T: Apa yang hilang dalam genom Candidatus Carsonella ruddii?

J: Banyak gen yang dianggap penting untuk kehidupan tampaknya hilang dalam genom Candidatus Carsonella ruddii, yang menunjukkan bahwa spesies ini mungkin telah mencapai status seperti organel.

T: Bagaimana genom Candidatus Carsonella ruddii dibandingkan dengan genom Mycoplasma genitalium?

J: Genom Mycoplasma genitalium, yang memiliki genom terkecil dari semua organisme yang hidup bebas, memiliki 521 gen, yang secara signifikan lebih tinggi daripada jumlah gen yang diprediksi pada Candidatus Carsonella ruddii.