Hydra adalah bulan terjauh Pluto. Bulan ini ditemukan bersama dengan Nix pada bulan Juni 2005 oleh Tim Pencarian Pendamping Pluto Teleskop Hubble, yang terdiri dari Hal A. Weaver, Alan Stern, Max J. Mutchler, Andrew J. Steffl, Marc W. Buie, William J. Merline, John R. Spencer, Eliot F. Young, dan Leslie A. Young. Gambar penemuan diambil pada 15 Mei 2005 dan 18 Mei 2005; bulan-bulan itu ditemukan secara independen oleh Max J. Mutchler pada 15 Juni 2005 dan Andrew J. Steffl pada 15 Agustus 2005. Penemuan-penemuan itu diumumkan pada 31 Oktober 2005, setelah konfirmasi oleh precoveries dari tahun 2002. Bulan-bulan tersebut untuk sementara diberi nama S/2005 P 1 (Hydra) dan S/2005 P 2 (Nix).
Bulan ini mengorbit barycenter sistem pada bidang yang sama dengan Charon dan Nix, pada jarak sekitar 65.000 km. Tidak seperti bulan-bulan Pluto lainnya, orbitnya hanya hampir melingkar; eksentrisitasnya 0,0052 kecil, tetapi secara signifikan tidak nol. Periode orbitnya 38,2 hari.
Meskipun ukurannya belum diukur secara langsung, perhitungan berdasarkan kecerahannya memberikan diameter antara 61 km, jika reflektifitasnya mirip dengan Charon 35 persen, dan sekitar 167 km, jika memiliki reflektifitas 4 persen seperti objek sabuk Kuiper tergelap (KBO). Pada saat penemuan, Hydra sekitar 25 persen lebih terang daripada bulan saudaranya Nix, yang menyebabkan asumsi bahwa diameternya sekitar 10 persen lebih besar. Data pra-penemuan dari pengamatan Hubble pada 2002-3 menyimpulkan bahwa Nix adalah bulan yang lebih terang. Namun, pengamatan Hubble pada tahun 2005-6, yang secara khusus menargetkan bulan-bulan redup, sekali lagi menunjukkan Hydra sedikit lebih terang. Hydra tampak berwarna abu-abu seperti Charon dan Nix, meskipun Pluto berwarna kemerahan.
Hydra akan dikunjungi bersama Pluto oleh misi New Horizons pada tahun 2015.
Nama Hydra diumumkan pada 21 Juni 2006, dalam IAU Circular 8723, bersama dengan sebutan resmi Pluto III. Nama Hydra diambil dari nama Hydra, monster yang menjaga perairan dunia bawah Pluto/Hades dalam mitologi Yunani-Romawi.
