Pautan genetik terjadi ketika alel pada lokus yang berbeda tidak bersegregasi secara acak. Dengan demikian, hukum kedua Mendel rusak.
Gen-gen dihubungkan ketika mereka berada pada kromosom yang sama. Mereka kemudian cenderung tetap bersama selama meiosis. Alel untuk gen pada kromosom yang berbeda biasanya tidak terkait, karena bermacam-macam kromosom yang independen selama meiosis.
Ada beberapa persilangan DNA selama meiosis ketika kromosom bersegregasi. Jadi, alel-alel pada kromosom yang sama dapat dipisahkan dan masuk ke sel anak yang berbeda. Ada kemungkinan yang lebih besar dari hal ini terjadi jika alel-alelnya terpisah jauh pada kromosom, karena lebih besar kemungkinannya akan terjadi persilangan di antara mereka. Jarak relatif antara dua gen dapat dihitung dengan menggunakan keturunan organisme yang menunjukkan dua sifat genetik yang terkait. Persentase keturunan di mana kedua sifat tidak berjalan bersama dicatat. Semakin tinggi persentase keturunan yang menunjukkan kedua sifat tersebut, semakin dekat pada kromosom kedua gen tersebut.
Ini adalah teknik pertama yang digunakan untuk memetakan gen pada kromosom. Dengan menghitung jumlah rekombinan, dimungkinkan untuk mendapatkan ukuran jarak antara gen-gen. Jarak ini disebut unit peta genetik (m.u.), atau centimorgan dan didefinisikan sebagai jarak antara gen-gen yang mana satu produk meiosis dalam 100 adalah rekombinan. Frekuensi rekombinan (RF) sebesar 1% setara dengan 1 m.u. Peta keterkaitan dibuat dengan menemukan jarak peta antara sejumlah sifat yang ada pada kromosom yang sama, idealnya menghindari kesenjangan yang signifikan di antara sifat-sifat untuk menghindari kemungkinan crossover ganda.