Pada sekitar 3600 SM, masyarakat Mesir neolitik di Sungai Nil bercocok tanam dan bertani dengan hewan. Tak lama setelah 3600 SM, masyarakat Mesir mulai tumbuh dan maju dengan cepat. Mereka membuat tembikar dengan gaya baru dan mulai menggunakan tembaga. Orang Mesir mulai menggunakan batu bata yang dikeringkan dengan sinar matahari untuk bangunan. Mereka juga mulai menggunakan lengkungan, dan dinding tersembunyi untuk efek dekoratif.
Masyarakat dan kota-kota di hulu Sungai Nil, atau Mesir Hulu mulai bergabung bersama. Hal ini juga terjadi di Delta Nil, atau Mesir Hilir. Sering terjadi peperangan antara Mesir Hulu dan Hilir. Selama pemerintahannya di Mesir Hulu, Raja Narmer mengalahkan musuh-musuhnya di Delta. Dia menggabungkan Kerajaan Mesir Hulu dan Hilir bersama-sama di bawah pemerintahannya. Narmer ditampilkan dalam gambar-gambar yang mengenakan mahkota ganda, yang disebut Pschent, dengan bunga teratai dari Mesir Hulu dan buluh papirus dari Mesir Hilir. Simbol-simbol Mesir yang bersatu ini digunakan oleh semua penguasa di masa depan. Dalam mitologi, dewa elang, Horus dari Mesir Hilir, memenangkan pertempuran melawan dewa Seth, dari Mesir Hulu. Hal ini membantu memulai gagasan bahwa raja-raja Mesir adalah dewa dan ilahi, yang berlangsung selama 3.000 tahun. Ini adalah dasar dari pemerintahan Mesir. Penyatuan masyarakat Sungai Nil juga dikaitkan dengan pengeringan Sahara.
Orang-orang kaya mulai memiliki praktik pemakaman yang lebih kompleks. Orang Mesir mulai membangun mastabas yang menjadi model untuk bangunan-bangunan selanjutnya, seperti Piramida Langkah Kerajaan Lama. Penanaman tanaman sereal dan penggunaan kontrol pusat untuk mengatur pekerja pertanian membantu keberhasilan negara selama 800 tahun ke depan.
Tampaknya pasti bahwa Mesir telah disatukan secara budaya dan ekonomi jauh sebelum raja pertamanya memerintah dari kota Memphis. Penyatuan politik merupakan proses yang lambat, berlangsung selama satu abad atau lebih. Daerah-daerah setempat memulai jaringan perdagangan dan pemerintah mampu mengorganisir para pekerja pertanian dalam skala besar. Kedudukan sebagai raja ilahi menjadi penting seiring dengan menyebarnya pemujaan terhadap dewa-dewa seperti Horus, Seth dan Neith ke seluruh negeri.
Sistem penulisan Mesir dikembangkan lebih lanjut. Pada awalnya tulisan Mesir hanya berupa beberapa simbol yang menunjukkan jumlah dari berbagai item. Pada akhir dinasti ketiga, tulisan itu telah berkembang menjadi lebih dari 200 simbol, baik fonogram maupun ideogram.
